Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms