Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PADI4Q9UM07 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms