Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB23Q9ULC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms