Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GINM1Q9NU53 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms