Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNFRSF19Q9NS68 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms