Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS45Q9NRW7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms