Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVBQ9HBI1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms