Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIK2Q9H0K1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms