Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms