Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HIRIP3Q9BW71 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms