Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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