Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms