Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms