Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZC2HC1AQ96GY0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms