Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms