Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM5Q96DZ9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms