Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms