Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1AQ96CP6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms