Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP4CQ96CF2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms