Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD2Q96BF3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms