Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.662e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PPP2R2D-207ENST00000616467 2058 ntTSL 1 (best)25.28■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATXN7-205ENST00000474513 728 ntTSL 1 (best)25.22■■□□□ 1.632e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PITPNA-209ENST00000576010 573 ntTSL 525.13■■□□□ 1.612e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PITPNA-211ENST00000576761 589 ntTSL 425.13■■□□□ 1.612e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.542e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 JADE2-210ENST00000515554 549 ntTSL 424.61■■□□□ 1.532e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM94-206ENST00000577380 554 ntTSL 424.39■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.472e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-214ENST00000558863 1355 ntTSL 524.19■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 VGLL4-206ENST00000418000 792 ntTSL 324.17■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FAM117A-206ENST00000506156 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.14■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC25A15-204ENST00000478827 1142 ntTSL 524.09■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.412e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.412e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.42e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 METTL27-203ENST00000493174 823 ntTSL 223.74■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 METTL27-202ENST00000458679 539 ntTSL 423.74■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.389e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.369e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 323.38■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.329e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GRAMD2B-213ENST00000513913 586 ntTSL 423.14■■□□□ 1.292e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.282e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RRAS2-204ENST00000526717 815 ntTSL 323.03■■□□□ 1.282e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.269e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 IDUA-206ENST00000508168 520 ntTSL 322.85■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 IDUA-205ENST00000506561 692 ntTSL 222.85■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GRAMD2B-216ENST00000514932 632 ntTSL 422.76■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC38A9-208ENST00000504880 2040 ntTSL 522.6■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.22e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EBF4-208ENST00000491472 665 ntTSL 522.16■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PTGES2-212ENST00000496594 2103 ntTSL 522.07■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MTCH1-204ENST00000460219 1572 ntTSL 222.06■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 521.98■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RRAS2-209ENST00000532950 888 ntTSL 321.87■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 221.84■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.082e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RNF40-203ENST00000493683 5371 ntTSL 221.74■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCARB2-212ENST00000638663 1922 ntTSL 521.6■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 COCH-209ENST00000555881 782 ntTSL 221.57■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DTWD2-202ENST00000506980 1370 ntTSL 521.52■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EBF4-203ENST00000449079 2788 ntTSL 221.52■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PRKCZ-215ENST00000479263 1747 ntTSL 221.48■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KIF13A-211ENST00000507576 529 ntTSL 321.47■■□□□ 1.039e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 JADE2-206ENST00000431355 887 ntTSL 321.44■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PCSK7-203ENST00000525027 1312 ntTSL 421.43■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RBMS1-211ENST00000477486 562 ntTSL 421.39■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZCCHC4-204ENST00000507760 2045 ntTSL 1 (best)21.38■■□□□ 1.019e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ITSN1-220ENST00000451686 501 ntTSL 421.32■■□□□ 12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ABHD17A-203ENST00000588598 5425 ntTSL 221.31■■□□□ 19e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM94-224ENST00000582186 565 ntTSL 421.27■■□□□ 12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)21.26■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM94-211ENST00000579707 566 ntTSL 521.22■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LTB4R-205ENST00000556141 797 ntTSL 321.12■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 HAUS4-207ENST00000553794 570 ntTSL 520.92■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF274-214ENST00000621145 1646 ntTSL 220.72■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GRAMD2B-215ENST00000514099 1532 ntTSL 220.66■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 62.8
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