Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP7Q93009 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP7Q93009 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP7Q93009 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP7Q93009 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP7Q93009 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP7Q93009 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP7Q93009 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP7Q93009 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP7Q93009 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP7Q93009 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP7Q93009 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP7Q93009 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP7Q93009 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP7Q93009 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP7Q93009 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP7Q93009 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP7Q93009 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP7Q93009 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP7Q93009 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP7Q93009 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP7Q93009 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP7Q93009 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP7Q93009 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP7Q93009 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP7Q93009 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP7Q93009 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP7Q93009 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP7Q93009 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP7Q93009 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP7Q93009 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP7Q93009 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP7Q93009 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP7Q93009 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP7Q93009 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP7Q93009 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP7Q93009 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP7Q93009 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP7Q93009 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP7Q93009 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP7Q93009 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP7Q93009 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP7Q93009 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP7Q93009 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP7Q93009 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP7Q93009 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP7Q93009 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP7Q93009 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP7Q93009 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP7Q93009 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP7Q93009 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP7Q93009 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP7Q93009 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP7Q93009 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP7Q93009 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP7Q93009 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP7Q93009 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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