Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDAQ92838 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDAQ92838 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDAQ92838 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDAQ92838 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDAQ92838 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EDAQ92838 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDAQ92838 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDAQ92838 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDAQ92838 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDAQ92838 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDAQ92838 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDAQ92838 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDAQ92838 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EDAQ92838 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDAQ92838 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDAQ92838 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EDAQ92838 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDAQ92838 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDAQ92838 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDAQ92838 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDAQ92838 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDAQ92838 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDAQ92838 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EDAQ92838 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDAQ92838 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDAQ92838 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDAQ92838 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDAQ92838 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDAQ92838 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDAQ92838 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDAQ92838 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDAQ92838 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDAQ92838 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDAQ92838 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDAQ92838 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDAQ92838 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDAQ92838 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDAQ92838 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDAQ92838 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDAQ92838 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDAQ92838 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDAQ92838 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDAQ92838 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDAQ92838 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms