Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF4BQ92750 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms