Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC1Q92574 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms