Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS9Q8WXC6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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