Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG1Q8WTW3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG1Q8WTW3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms