Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
RB1CC1Q8TDY2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC42.72■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC42.71■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC42.69■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC42.69■■■■■ 4.43
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC42.67■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 891.1 ms