Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPUSD2Q8IZ73 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms