Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM48Q8IWZ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM48Q8IWZ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms