Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDB1Q86U70 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LDB1Q86U70 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms