Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8S5

OTUD6A, OTU domain-containing protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6AQ7L8S5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTUD6AQ7L8S5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD6AQ7L8S5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms