Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB2Q71RG4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms