Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC149Q6ZUS6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC149Q6ZUS6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms