Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP10Q6VN20 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms