Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO38Q6PIJ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms