Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC27Q6P3X3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms