Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV7

CDPF1, Cysteine-rich DPF motif domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDPF1Q6NVV7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDPF1Q6NVV7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms