Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV0

FOXB2, Forkhead box protein B2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB2Q5VYV0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXB2Q5VYV0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXB2Q5VYV0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms