Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GKAP1Q5VSY0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms