Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms