Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAB41Q5JT25 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB41Q5JT25 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms