Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TAF1BQ53T94 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms