Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms