Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNPY1Q3B7I2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNPY1Q3B7I2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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