Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDO1Q16878 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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