Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIL3Q16649 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms