Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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