Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USF2Q15853 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USF2Q15853 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USF2Q15853 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USF2Q15853 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USF2Q15853 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USF2Q15853 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USF2Q15853 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USF2Q15853 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USF2Q15853 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USF2Q15853 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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