Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP3Q15836 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms